Как пояснили врачи, установленное в операционных оборудование, позволяет минимизировать у пациентов риск послеоперационных инфекционных осложнений. Залы оснащены автоматическими дверями, работающими по шлюзовому типу, светодиодными операционными светильниками, электрогидравлическими операционными столами, современным электрохирургическим оборудованием, системой ламинарных потоков воздуха с раздельным управлением и контроллерами давления воздуха для каждого зала. В одной из операционных в светильник встроена система видеорегистрации, позволяющая организовывать онлайн-видеотрансляции и видеоконференции, а также записывать ход операций.

В оперблоке есть палата посленаркозной адаптации, оснащенная всей необходимой наркозно-дыхательной и следящей аппаратурой.

На капитальный ремонт и оснащение операционных было направлено порядка 70 миллионов рублей. В настоящее время весь объединенный операционный блок ГНОКБ состоит из 20 функционирующих операционных залов (27 операционных столов).